Nach Angaben der Dokumentation besteht Polygon Chain aus zwei Schichten, die zusammenarbeiten. Heimdall, die Konsensschicht, ist eine Gruppe von Proof-of-Stake-Knoten, die Staking-Verträge auf Ethereum beobachten, Bor-Blockdaten prüfen und regelmäßig Checkpoints (Prüfpunkte) an das Ethereum-Mainnet senden. Bor, die Ausführungsschicht, besteht aus blockproduzierenden Knoten, die EVM-Transaktionen ausführen. Je Span (Zeitabschnitt) gibt es genau einen Blockproduzenten, den Heimdall aus einem kleinen Kreis zugelassener Validatoren auswählt.
Nach Angaben der Dokumentation wird mit Heimdall v2 deterministische Finality (Endgültigkeit von Transaktionen) in 2 bis 5 Sekunden über einen Mechanismus aus Meilensteinen erreicht. Stimmen mindestens zwei Drittel der von Validatoren hinterlegten Menge zu, gilt die Abfolge als neuer Meilenstein. Checkpoints sind Merkle Roots (Wurzelwerte) der Bor-Blockdaten, die in Abständen an Ethereum gesendet werden, die ein Governance-Parameter festlegt. Eine Auszahlung auf Ethereum kann erst finalisiert werden, nachdem der zugehörige Checkpoint eingereicht und geprüft wurde.
Nach Angaben der Dokumentation hinterlegen Validatoren POL auf Ethereum. Erforderlich sind mindestens 10.000 POL, ein Wert, der per PIP-4 angehoben wurde. Das Netz unterstützt bis zu 105 aktive Validatoren gleichzeitig.